L’histoire naturelle du syndrome de Kennedy n’est pas encore connue avec précision du fait du petit nombre de personnes atteintes et aussi d’une certaine hétérogénéité entre les différents patients concernés. Il est donc difficile de prédire l’évolution de la maladie à titre individuel.

 

Il est admis que le syndrome de Kennedy est une maladie d’origine neuromusculaire d’évolution lente ; il existe néanmoins des formes plus graves ou évoluant plus rapidement.

 

Ce sont les troubles de la déglutition et/ou de la fonction respiratoire (complications bulbaires) qui font la gravité de la maladie. Au risque de faiblesse progressive de certains muscles respiratoires (notamment du diaphragme) s’ajoutent les risques de fausses routes alimentaires dues à la faiblesse de certains muscles de la gorge (muscles pharyngés).

 

Du fait d’une gêne croissante à la marche, un certain nombre de patients ont recours à un scooter électrique ou un fauteuil roulant au bout de 20 à 30 ans après l'apparition des premières difficultés.

 

Le test génétique ne permet pas vraiment de prédire le potentiel évolutif (l’évolutivité) de la maladie. En revanche, on sait désormais que plus l’expansion de triplets CAG est grande, plus précoce sera le début de la maladie. L'importance des manifestations endocriniennes est également corrélée à la taille de l’expansion.