Le motoneurone est une cellule nerveuse qui conduit le signal de contraction jusqu’au muscle. Dans le syndrome de Kennedy, le motoneurone atteint (motoneurone périphérique) se situe dans la moelle épinière et reçoit les signaux de commande du cortex cérébral qui contrôle les mouvements volontaires, via un premier motoneurone (motoneurone central). Alors que dans le syndrome de Kennedy, seul le deuxième neurone est atteint, dans la SLA le premier et le deuxième motoneurones sont tous les deux atteints.
Les manifestations endocriniennes sont liées à une insensibilité aux androgènes, hormones qui stimulent physiologiquement le développement et le maintien des caractères sexuels masculins.

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