En 2008, l'AFM a engagé 60,5 millions d'euros dans sa mission Guérir qui se répartissent de la manière suivante :
> Recherche et développement des thérapeutiques : 27,3 Millions d'euros
> Laboratoire Généthon : 21,6 Millions d'euros
> Institut de Myologie : 8,4 Millions d'euros
> I-Stem : 3,2 Millions d'euros

Focus : Recherche et développement des thérapeutiques (hors Généthon, Institut de Myologie et I-Stem) - 27,3 millions d'euros répartis de la manière suivante :

> Partenariats académiques (site de Nantes, Institut Pasteur, GIS/ANR, AP-HP, Inserm, CNRS, Génopole, Fondation Imagine, réseau Treat-NMD) : 7,2 Millions d'euros
> Partenariats internationaux (université de Pennsylvanie - USA, université Laval-Canada, Programme Tremblay) : 1 Million d'euros
> Appels d’offres : 10,2 Millions d'euros
> Programmes de coopération industrielle (diverses sociétés de biotechnologie françaises et étrangères) : 3,3 Millions d'euros
> Associations de malades (Vaincre la Mucoviscidose, IRME, Alliance San Filippo) : 2,8 Millions d'euros
> Autres : 2,8 Millions d'euros