Inciter les équipes de recherche à travailler sur les thématiques qui intéressent l'AFM : comprendre les maladies neuromusculaires et mettre au point de nouvelles thérapeutiques.

L'AFM soutient des projets issus d'appels d'offres, après expertise par le Conseil Scientifique ou par des comités d'experts. Composé de chercheurs et de cliniciens bénévoles, le Conseil scientifique de l'AFM est un organe de conseil et de proposition. Il est chargé de déterminer les axes de recherche prioritaires, de les proposer au Conseil d'administration de l'AFM et d'émettre les appels d'offre correspondants. Il évalue l'adéquation et la qualité des programmes de recherche proposés et contrôle, a posteriori, la qualité des travaux. Il peut s'appuyer sur des experts scientifiques nationaux ou internationaux. Les dossiers comportant l'avis du Conseil scientifique sont présentés à la commission scientifique des administrateurs qui donne son avis et pré-valide. La validation finale de l'engagement financier est donnée par le Bureau du Conseil d'Administration ou le Conseil d'Administration selon l'importance des projets.

En 2008, ce sont 321 subventions et soutiens à des doctorants ou post-doctorants qui ont été accordés dans le cadre de l'appel d'offres "Myologie fondamentale et développement des thérapeutiques".

Financements 2008 : 10,2 millions d'euros.