Parce q'un diagnostic juste et précis détermine une prise en charge adaptée à chaque maladie, l'AFM a soutenu la mise en place dans toute la France de consultations disciplinaires dédiées aux maladies neuromusculaires. Elles garantissent aux malades la qualité des soins et une prise en charge, dans un même lieu, par les différents spécialistes concernés.
Forte de son expérience, l'Association a participé, dès 2002, au groupe de travail ministériel chargé de la rédaction d'un cahier des charges établissant les spécifications de consultations pluridisciplinaires pouvant être labellisées "centres de référence de maladies rares". La labellisation en 2004 des premiers centres de référence pour des groupes de pathologies rares doit améliorer l'accès à un diagnostic et à des soins adaptés.